政府工作部门
市司法局
市人民防空办公室
赣州市教育局
市林业局
赣州市文化广电新闻出版旅游局
赣州市应急管理局
赣州市发展和改革委员会
赣州市农业农村局
市商务局
赣州市人民政府办公室
市科学技术局
赣州市工业和信息化局
赣州市公安局
赣州市民政局
市财政局
市人力资源和社会保障局
赣州市自然资源局
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赣州市住房和城乡建设局
市交通运输局
市水利局
赣州市卫生健康委员会
赣州市退役军人事务局
赣州市审计局
赣州市市场监督管理局(市知识产权局)
市统计局
赣州市乡村振兴局
赣州市医疗保障局（2019年）
市城市管理局
市国有资产监督管理委员会
赣州市行政审批局（市政务服务管理办公室)
赣州市金融工作办公室
市体育局
赣州市赣南苏区振兴发展工作办公室
直属事业单位
赣州市铁路建设发展中心
赣州市水土保持中心
市果业发展中心
市档案局
赣州市人民政府发展研究中心
市供销合作社
赣南科学院
市地方志办公室
市住房公积金管理中心
省垂直管理机构
国家税务总局赣州市税务局
中国人民银行赣州市中心支行
赣州银保监分局
赣州市气象局
江西赣州供电公司
赣州市邮政局
中国石化赣州分公司
江西省港航管理局赣州分局
赣州市烟草专卖局
赣州市水文局
赣州海关
民航赣州机场
赣州市无线电管理局